Особенности эпидемического процесса при распространении новой коронавирусной инфекции COVID-19 на территории мегаполиса в период 2020–2022 годов

Введение. Проведение комплексного эпидемиологического анализа развития пандемии СОVID-19 в условиях мегаполиса представляет интерес для специалистов разного профиля (эпидемиологов, инфекционистов, педиатров, терапевтов, иммунологов, вирусологов). Важным элементом эпидемиологического надзора является оценка коллективного иммунитета к возбудителям инфекционных заболеваний, в том числе и к вирусу SARS-CoV-2. Природная способность вирусов к изменчивости приводит к появлению новых типов и штаммов. В настоящее время идентифицирован ряд мутаций и полиморфизмов, влияющих на структуру и стабильность белков, факторов восприимчивости к инфекции SARS-CoV-2, патогенности и вирулентности вируса, способности к «ускользанию» от иммунного ответа организма-хозяина.

Цель работы – оценить характер развития эпидемического процесса новой коронавирусной инфекции на территории мегаполиса в период 2020–2022 гг.

Материалы и методы. Методом ПЦР на наличие РНК SARS-CoV-2 в мазках из носои ротоглотки обследовано 331 013 человек. Специфические антитела IgM и IgG к SARS-CoV-2 в сыворотке крови выявляли методом ИФА у 42 955 человек. Проведено типирование генетических вариантов вируса (методом ПЦР и секвенирования).

Результаты. За весь период наблюдения наибольший процент «положительных на Covid-19» отмечен в феврале 2022 г. (58,9 %) и сентябре 2022 г. (46,8 %). Среди всех обследованных (n = 331 013) взрослые пациенты составили наибольшую часть, – 83,9 %, дети – 16,1 %. Доля лиц с наличием специфических IgG к SARS-CoV-2 в 2020–2021 гг. была в пределах 53,3–82,6 %.

Обсуждение. В 2020–2022 гг. отмечено увеличение доли лиц с выявленной РНК вируса. Наибольшее инфицирование наблюдали в возрастных группах 19–27 лет и 28–65 лет. Установлено, что линейная зависимость нарастания удельного веса серопозитивных лиц в отношении IgG среди жителей Екатеринбурга имеет прогрессивную тенденцию, коэффициент достоверности аппроксимации R2 соответствует 0,8172. В пробах пациентов, обследованных в апреле–августе 2022 г., в 96,9 % случаев выявлены маркеры генетического варианта Omicron. Увеличение в структуре инфицированных детского населения (практически в два раза за 2020–2022 гг.), возможно, вызвано приспособлением возбудителя к новой восприимчивой когорте людей.

Заключение. Динамика количества обследованных и доли выявляемости РНК SARS-CoV-2 в Екатеринбурге за весь период пандемии (март 2020 г. – декабрь 2022 г.) имела волнообразный характер. К концу 2022 г. значительно вырос уровень серопозитивных лиц во всех возрастных группах, что подтверждает наличие на территории сформировавшегося коллективного иммунитета.

1. Бевова М.Р., Нетесов С.В., Аульченко Ю.С. Новая коронавирусная инфекция Covid-19. Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. 2020;38(2):51–58. http://doi.org/10.17116/molgen20203802151.

2. Супотницкий М.В. Новый коронавирус SARS-CoV-2 в аспекте глобальной эпидемиологии коронавирусных инфекций. Вестник войск РХБ защиты.2020;4(1):32–65. https://doi.org/10.35825/2587-5728-2020-4-1-32-65.

3. Кононенко А.А., Носков А.К., Водяницкая С.Ю. c соавт. Коронавирусы человека, способные вызывать чрезвычайные ситуации. Медицинский вестник Юга России. 2021;12(1):14–23. https://doi.org/10.21886/2219-8075-2021-12-1-14-23.

4. Никонова А.А., Файзолуев Е.Б., Грачева А.В с соавт. Генетические разнообразие и эволюция биологических свойств коронавируса SARS-CoV-2 в условиях глобального распространения. ACTA NATURA. 2021;13(3–50):77–90. https://doi.org/10.32607/actanaturae.11337.

5. McIntosh K. COVID-19: Epidemiology, virology and prevention. 2023. URL: https://www.uptodate.com/contents/covid-19-epidemiology-virology-and-prevention?sectionName=EPIDEMIOLOG#H3392906512.

6. Дмитриева Л.Н., Краснов Я.М., Чумачкова Е.А. с соавт. Распространение вариантов вируса SARS-COV-2, вызывающих озабоченность (VOC) на основе количества их геномов, депонированных в базу данных GISAIDзанеделюс 14.01.2023 г. по 20.01.2023 г. COVID19-PREPRINTS.MICROBE.RU. http://doi.org/10.21055/preprints-3112163.

7. Хайтович А.Б., Ермачкова П.А. Коронавирусные инфекции (мутации, генотипы). Крымский журнал экспериментальной клинической медицины. 2021;11(1):61–75. http://doi.org/10.37279/2224-6444-2021-11-1-61-75.

8. Новикова И.А. Генетическая характеристика вируса SARS-CoV-2. Живые и биокосные системы. 2021;35:4. http://doi.org/10.18522/2308-9709-2021-35-4.

9. Вологжанин Д.А., Голота А.С., Камилова А.С. с соавт. Генетика Covid-19. Клиническая практика. 2021;12(1):41–52. http://doi.org/10.17816/clinpract64972.

10. Korber B, Fischer WM, Gnanakaran S et al. Tracking changes in SARS-CoV-2 spike: evidence that D614G increases infectivity of the COVID-19 Virus. Cell. 2020’182(4):812–827.e19. http://doi.org/10.1016/j.cell.2020.06.043.

11. Попова А.Ю., Андреева Е.Е., Бабура Е.А. с соавт. Особенности формирования серопревалентности населения Российской Федерации к нуклеокапсиду SARS-CoV-2 в первую волну эпидемии COVID-19. Инфекция и иммунитет. 2021;11(2):297–323. http://doi.org/10.15789/2220-7619-FOD-1684.

12. Перевезенцев О.А., Холодня Т.О., Бурцев Д.В. Зарубежный опыт молекулярно-генетической и иммунологической диагностики SARS-CoV-2 (обзор). Лабораторная служба. 2021;10(4):47–54. http://doi.org/10.17116/labs20211004147.

13. Попова А.Ю., Тотолян А.А. Методология оценки популяционного иммунитета к вирусу SARS-CoV-2 в условиях пандемииCOVID-19. Инфекция и иммунитет. 2021;11(4):609–616. http://doi.org/10.15789/2220-7619-MFA-1770.

14. Годков М.А.,ШустовВ.В.,Кашолкина Е.А. Динамика и гендерно-возрастные особенности эпидемического процесса COVID-19 в городе Москве (итоги скринингового обследования за 1,5 года). Лабораторная служба. 2021;10(4):30–37. http://doi.org/10.17116/labs20211004130.

15. Попова А.Ю., Тарасенко А.А., Смоленский В.Ю. с соавт. Коллективный иммунитет к SARS-CoV-2 населения Республики Беларусь в условиях пандемии COVID-19. Инфекция и иммунитет. 2021;11(5):887–904. http://doi.org/10.15789/2220-7619-HIT-1798.

16. Решетникова И.Д., Тюрин Ю.А., Агафонов Е.В. Изучение особенностей гуморального иммунного ответа к новой коронавирусной инфекции COVID-19 среди медицинских работников. Инфекция и иммунитет. 2021;11(5):934–942. http://doi.org/10.15789/2220-7619-SOT-1587.

17. Liguoro I, Pilotto C, Bonanni M et al. SARS-COV-2 infection in children and newborns: a systematic review. Eur J Pediatr. 2020;179(7):1029–1046. http://doi.org/10.1007/s00431-020-03684-7.

18. Малых А.Л., Ибрагимова Б.А, Малых Д.А, с соавт. Современные особенности течения новой коранавирусной инфекции у детей и подростков. Современные проблемы науки и образования. 2022;2. http://doi.org/10.17513/spno.31545.

19. Lauring AS, Hodcroft EB. Genetic Variants of SARS-CoV-2 What do they mean? JAMA. 2021;325(6):529–531. http://doi.org/10.1001/jama.2020.27124.

20. Акимкин В.Г., Кузин С.Н., Семененко Т.А. с соавт. Закономерности эпидемического распространения SARSCoV-2 в условиях мегаполиса. Вопросы вирусологии. 2020;65(4):203–211. http://doi.org/10.36233/0507-4088-2020-65-4-203-211.